农业生产中产生的废水，比如农田灌溉排水、农药喷洒后的冲洗水，里面含有农药残留和化肥成分，检测的时候要重点关注农药残留指标，这些物质会污染土壤和水源，影响生态环境。检测农业废水要在农田的排水口布点，每次喷洒农药后几天内进行检测，这时候农药残留浓度最高。
不同的农药要用不同的检测方法，比如有机磷农药要用气相色谱仪配火焰光度检测器检测，菊酯类农药要用气相色谱仪配电子捕获检测器检测，检测精度要高，才能发现低浓度的农药残留。除了农药残留，农业废水中的氮、磷含量也要测，这些成分会导致水体富营养化，让水藻大量繁殖，影响水质。
农民要合理使用农药和化肥，按照规定的剂量和方法喷洒，别过量使用，减少农药残留进入废水。可以采用生态农业的方法，比如用生物农药代替化学农药，用有机肥代替化肥，从源头减少污染。农田附近可以建小型的废水处理池，种上水生植物，比如芦苇、荷花，这些植物能吸收废水中的氮、磷和农药残留，净化废水。农业废水处理好了，才能保护农村的水环境，实现农业可持续发展。